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28 maladies répertoriées
SARS-CoV-2 (variants BA.2.86, NB.1.8.1, XFG…)
Infection respiratoire causée par SARS-CoV-2. Endémique depuis 2020. Les nouvelles lignées (NB.1.8.1, XFG) restent sous surveillance en Europe début 2026. L'activité hivernale 2025-2026 est restée modeste aux États-Unis (CDC).
Chikungunya virus (CHIKV)
Transmission autochtone confirmée dans 119 pays (OMS 2025) ; 27 pays supplémentaires présentent des populations de Aedes sans transmission signalée. Cas autochtones observés chaque année dans le sud de l'Europe (France, Italie, Espagne).
Vibrio cholerae O1/O139
Infection intestinale aiguë à déshydratation potentiellement fatale. Liée à l'accès à l'eau potable et à l'assainissement. Foyers fréquents en Afrique subsaharienne, Asie du Sud et zones de conflit humanitaire. Vaccins oraux disponibles mais peu déployés.
Dengue virus (DENV 1-4)
Endémique dans plus de 100 pays tropicaux. ECDC mars 2026 : plus de 500 000 cas et 100 décès dans le monde, dont 299 210 cas dans les Amériques. Expansion géographique vers l'Europe favorisée par Aedes albopictus (moustique tigre).
Ebola virus (EBOV, SUDV, BDBV…)
Fièvre hémorragique virale à létalité très élevée (25-90 % selon la souche). Foyer actif en RDC et Ouganda signalé en mai 2026 (ReliefWeb/ECDC). Réservoirs : chauves-souris frugivores. Transmission interhumaine par fluides corporels.
Rift Valley Fever virus (RVFV)
Endémique en Afrique de l'Est et du Sud. Zoonose pouvant toucher l'humain lors d'épidémies liées à des pluies abondantes. Le changement climatique étend les zones à risque. Aucun vaccin humain disponible. Surveillance renforcée par l'OMS.
Crimean-Congo Hemorrhagic Fever virus (CCHFV)
Fièvre hémorragique à létalité pouvant atteindre 50 %. Endémique en Afrique, Moyen-Orient, Asie centrale et dans les Balkans. Cas annuels en Irak et Turquie signalés en mai 2026. Absence de vaccin approuvé. Risque de transmission nosocomiale.
Yellow fever virus (YFV)
Endémique en Afrique subsaharienne et dans certaines régions d'Amérique du Sud. Vaccination obligatoire pour les voyageurs vers les zones à risque. Des campagnes de vaccination ont réduit les flambées mais des cas sporadiques persistent.
Influenza A (H5N1, H5N2, H7N9, H9N2)
Souches influenza A d'origine aviaire. Transmission humaine rare mais sévère. H5N1 détecté chez des bovins laitiers aux États-Unis (Gavi 2026). Premier cas humain H9N2 importé dans l'UE signalé en Italie (ECDC mars 2026). Surveillance active en raison du risque d'adaptation aux mammifères.
Influenza A(H1N1), A(H3N2), B
Infections grippales saisonnières circulant chaque année. Printemps 2026 : activité grippale élevée dans certaines régions d'Europe ; sous-clade K de A(H3N2) représente 92 % des virus caractérisés aux États-Unis (CDC/ECDC).
Hantavirus (HTNV, SEOV, SNV, ANDV…)
Syndrome pulmonaire ou rénal transmis par contact avec des rongeurs infectés. Mai 2026 : regroupement de cas de syndrome pulmonaire à hantavirus (virus Andes) à bord d'un navire de croisière, plusieurs décès signalés. Plusieurs espèces circulent en Europe (Puumala, Dobrava).
Hepatitis B virus (HBV)
Infection hépatique chronique endémique en Afrique subsaharienne, Asie et Europe de l'Est. OMS 2026 : ~240 millions de personnes infectées chroniquement dans le monde. Moins de 5 % des personnes infectées sont traitées.
Hepatitis C virus (HCV)
Infection hépatique chronique. OMS 2026 : ~47 millions de personnes infectées. Environ 1,3 million de décès/an liés aux hépatites virales (cirrhose, cancer du foie). Traitements efficaces disponibles mais couverture insuffisante.
Lassa virus (LASV)
Fièvre hémorragique endémique en Afrique de l'Ouest (Nigeria, Sierra Leone, Guinée, Liberia). 15-20 % de létalité chez les patients hospitalisés. Aucune vaccination disponible. Risque de propagation en zones urbaines en l'absence de contrôle.
Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus
Coronavirus à létalité élevée (~35 %). Endémique sur la péninsule Arabique depuis 2012. ECDC : 2 647 cas et 959 décès cumulés depuis 2012. Deux cas importés en France après voyage en Arabie Saoudite signalés en décembre 2025.
Marburg virus (MARV)
Fièvre hémorragique de la même famille qu'Ebola. Létalité souvent supérieure à 50 %. Flambée en Éthiopie novembre 2025 (14 cas confirmés, 9 décès). Fin de l'épidémie déclarée le 26 janvier 2026 par le gouvernement éthiopien.
Monkeypox virus (MPXV clade I et II)
Deux clades en circulation (ECDC 2026) : clade I principalement en RDC, Ouganda et Burundi ; clade II à diffusion internationale via les réseaux sexuels. Des cas sporadiques sans lien de voyage signalés hors d'Afrique. La vaccination antivariolique réduit la sévérité.
Nipah virus (NiV)
Mortalité ~40-75 %. Transmission interhumaine possible. Deux infirmiers positifs confirmés au Bengale occidental (Inde) en janvier 2026 ; 196 contacts testés négatifs. Aucune thérapie spécifique approuvée (ECDC/ISGlobal).
Norovirus (calicivirus humain)
Virus très contagieux responsable de gastro-entérites aiguës. Endémique mondial avec pics saisonniers. UKHSA janvier 2026 : notifications 60 % supérieures à la moyenne quinquennale au Royaume-Uni. CDC : ~2 500 épidémies/an aux États-Unis.
Oropouche virus (OROV)
Virus originaire de Trinidad, désormais signalé en Amérique du Sud, Amérique centrale et Caraïbes. Cas autochtones rapportés au Brésil, au Pérou et en Équateur. Aucun vaccin disponible (Gavi 2026). Risque d'expansion vers d'autres régions tropicales.
Poliovirus (type sauvage et dérivé vaccinal type 2)
Polio sauvage endémique au Pakistan et en Afghanistan. Détections environnementales de poliovirus dérivé type 2 dans des eaux usées à Perth (Australie) et Londres début 2026. Aucune mesure supplémentaire requise dans ces villes. Surveillance active maintenue.
Respiratory Syncytial Virus
Virus respiratoire majeur chez les nourrissons et les personnes âgées. CDC mars 2026 : activité RSV élevée et en augmentation dans certaines régions ; taux d'hospitalisation de 3,2/100 000 au 21 février 2026.
Rotavirus A
Principale cause de diarrhées infantiles sévères dans les pays à faible couverture vaccinale. Début 2026, rapports de laboratoire au Royaume-Uni 11 % supérieurs à la moyenne quinquennale.
Measles morbillivirus
Virus extrêmement contagieux. CDC mai 2026 : 1 952 cas confirmés aux États-Unis dans 40 juridictions, liés à 29 éclosions. Plusieurs pays européens (Canada, Royaume-Uni, Espagne, Autriche) ont perdu leur statut d'élimination en 2025-2026 suite à une baisse de la couverture vaccinale.
Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome virus (SFTSV)
Fièvre sévère avec thrombocytopénie. Cas en hausse au Japon et en Corée du Sud début 2026. Transmission possible d'humain à humain mais rare. Surveillance renforcée.
Human Immunodeficiency Virus (HIV-1/HIV-2)
Infection virale chronique endémique mondiale. UNAIDS 2024 : 40,8 millions de personnes vivant avec le VIH, 1,3 million de nouvelles infections, 630 000 décès liés au sida. Largement contrôlé par les antirétroviraux dans les pays à accès suffisant.
West Nile virus (WNV)
Endémique en Europe méditerranéenne et centrale avec cycles épidémiques annuels. Début 2026 : cas équins confirmés en France (7), Italie (1) et Portugal (14). En 2023, 709 cas humains locaux et 67 décès en Europe.
Zika virus (ZIKV)
Présent en Afrique, Asie du Sud-Est et Amérique latine. Risque majeur pour les femmes enceintes (microcéphalie, syndrome de Guillain-Barré). Pas d'épidémie majeure signalée en 2025-2026 mais surveillance maintenue dans les zones de présence du vecteur.